MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Campylobacter concisus 13826 plasmid pCCON31

Total Repeats: 194

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009795	AT	3	6	1302	1307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009795	TA	3	6	1309	1314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009795	ATT	3	9	1317	1325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009795	TAA	2	6	1343	1348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009795	TAT	2	6	1349	1354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009795	ATA	2	6	1360	1365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009795	ATT	2	6	1378	1383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009795	TAA	2	6	1422	1427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009795	TATTTT	2	12	1433	1444	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009795	GTATA	2	10	1455	1464	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009795	AAAT	2	8	1487	1494	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009795	ATA	3	9	1509	1517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009795	TA	3	6	1520	1525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009795	AT	3	6	1529	1534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009795	A	6	6	1571	1576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009795	ATT	2	6	2503	2508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009795	ATTATA	2	12	2514	2525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009795	ATA	3	9	2539	2547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009795	AATAT	2	10	2555	2564	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009795	A	6	6	2578	2583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009795	ATA	2	6	2589	2594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009795	A	7	7	2594	2600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009795	ATA	2	6	2617	2622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009795	A	6	6	2630	2635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009795	AAC	2	6	2699	2704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009795	ATT	2	6	2711	2716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009795	TA	3	6	2717	2722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009795	T	6	6	2763	2768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009795	AGATTA	2	12	2788	2799	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009795	ATT	2	6	2821	2826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009795	A	6	6	2829	2834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009795	AAGG	2	8	2856	2863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009795	A	6	6	10132	10137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009795	TAA	2	6	10151	10156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009795	TGT	2	6	10169	10174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009795	AT	3	6	10210	10215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009795	ATT	2	6	10226	10231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009795	AAC	2	6	10259	10264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009795	CTA	2	6	10271	10276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009795	ATA	2	6	10295	10300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009795	TCA	2	6	10384	10389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009795	AG	3	6	10391	10396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009795	ACA	2	6	10454	10459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009795	TGA	3	9	10474	10482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009795	AGC	2	6	10504	10509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009795	TAA	2	6	12053	12058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009795	CAG	2	6	12078	12083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009795	GTA	2	6	12113	12118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009795	ATA	2	6	13166	13171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009795	GAAAAT	2	12	13207	13218	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009795	A	8	8	13228	13235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009795	A	7	7	13278	13284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009795	TA	3	6	13285	13290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009795	CTA	2	6	13298	13303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009795	AAT	2	6	13378	13383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009795	ATA	2	6	13394	13399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009795	AAT	2	6	13456	13461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009795	GTG	2	6	13529	13534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009795	ATA	2	6	13540	13545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009795	ATT	2	6	13564	13569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009795	AAGA	2	8	13876	13883	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009795	TAA	2	6	14272	14277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009795	TAT	2	6	14307	14312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009795	AT	3	6	18323	18328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009795	T	6	6	18333	18338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009795	AAATTT	2	12	18390	18401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009795	T	7	7	18399	18405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009795	TAG	2	6	18415	18420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009795	TTTA	2	8	19493	19500	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009795	T	6	6	19519	19524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009795	AACA	2	8	19592	19599	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009795	AGT	2	6	19626	19631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009795	GA	3	6	20852	20857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009795	T	6	6	20858	20863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009795	TAGC	2	8	20888	20895	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009795	TGCA	2	8	20899	20906	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009795	TAT	2	6	20960	20965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009795	TA	3	6	22217	22222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009795	AT	3	6	22223	22228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009795	T	6	6	22228	22233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009795	TTC	2	6	22249	22254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009795	ATA	2	6	22815	22820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009795	TTA	2	6	22893	22898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009795	TAT	2	6	22932	22937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009795	CTA	2	6	23171	23176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009795	ATAG	2	8	23204	23211	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009795	TTG	2	6	23235	23240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009795	AAG	2	6	23290	23295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009795	TA	4	8	23421	23428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009795	TA	3	6	23506	23511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009795	TTATT	2	10	23637	23646	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009795	AGT	2	6	23657	23662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009795	ATT	2	6	23686	23691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009795	GCA	2	6	23750	23755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009795	CGT	2	6	23812	23817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009795	TTTG	2	8	23858	23865	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009795	CTT	2	6	23881	23886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009795	T	7	7	23895	23901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009795	GTCTTT	2	12	24092	24103	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_009795	GTA	2	6	24134	24139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009795	T	6	6	24146	24151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009795	TAT	2	6	24761	24766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009795	TTTTA	2	10	25780	25789	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009795	TAT	2	6	25800	25805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009795	T	6	6	25814	25819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009795	T	6	6	25841	25846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009795	T	6	6	25858	25863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009795	ATT	2	6	25867	25872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009795	AT	3	6	25879	25884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009795	ATA	2	6	25899	25904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009795	ATTGT	2	10	25906	25915	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009795	TAA	2	6	25920	25925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009795	AT	4	8	25926	25933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009795	TTTA	2	8	25935	25942	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009795	ATT	2	6	25947	25952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009795	TAA	2	6	25955	25960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009795	T	7	7	25991	25997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009795	TAT	3	9	26012	26020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009795	A	6	6	26176	26181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009795	ATAG	2	8	26258	26265	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009795	A	6	6	26287	26292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009795	AT	3	6	26309	26314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009795	A	7	7	26658	26664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009795	TTTA	2	8	26669	26676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009795	ATT	2	6	26685	26690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009795	A	7	7	26706	26712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009795	T	6	6	26718	26723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009795	AAT	2	6	26724	26729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009795	TAA	2	6	26743	26748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009795	ATT	2	6	26757	26762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009795	ATAAAA	2	12	27999	28010	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009795	TAT	2	6	28016	28021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009795	A	6	6	28028	28033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009795	CT	3	6	28223	28228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_009795	T	7	7	28238	28244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009795	T	7	7	28265	28271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009795	A	6	6	28272	28277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009795	A	6	6	28286	28291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009795	T	6	6	28304	28309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009795	AAAG	2	8	28345	28352	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009795	ATT	2	6	28355	28360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009795	T	7	7	28359	28365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009795	ATT	2	6	28396	28401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009795	TAA	2	6	28405	28410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009795	ATT	2	6	28413	28418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009795	TAA	2	6	28438	28443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009795	TCT	2	6	28573	28578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_009795	CAT	3	9	28589	28597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_009795	GTT	2	6	28611	28616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009795	TGT	2	6	28628	28633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_009795	ATATGA	2	12	30926	30937	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.